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内容简介:
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书籍目录:
绪论/1篇 基础实践/9
项目1基因组测序模拟/9
项目2序列组装/16
项目3基因组注释之同源基因搜索/26
项目4基因组注释之从头预测与基因结构建模/37
项目5基因组注释之DNA元件预测/45
项目6基因组数据可视化/59
篇扩展实践/64
项目1高通量测序平台及模拟工具的对比/64
项目2基因组序列组装软件的对比/67
项目3 RNA-Seq数据从头组装软件的对比/70
项目4从头计算预测基因软件的比较/73
项目5基于转录组数据的新基因和转录变异体的发现/76
项目6基因转录调控分析/79
项目7基因组测序可视化工具的对比/87
第三篇 综合实践/90
项目1基因组测序模拟的编程实现/90
项目2同源基因搜索指导的基因结构预测 /94
项目3基于RNA-Seq数据的基因组注释/100
项目4 基于多重数据源的基因结构特征训练和应用 / 107
项目5基因结构特征模型参数的编程实践/110
项目6多重证据联合的基因结构建模/114
项目7转录因子调控机制分析/117
其他综合实践设想/123
第四篇常用软件使用手册/124
1. ART / 124
2. Augustus / 136
3. BamTools / 152
4. BCFtools / 156
5. bedtools / 191
6. Bowtie2 / 213
7. FastQC / 235
8.GFF格式处理工具/249
9. NCBI BLAST / 260
10. NCBI SRA Toolkit / 276
11. QUAST / 286
12. Samtools / 298
13. SOAPdenovo / 325
14. Trimmomatic / 339
15. Trinity / 343
16.文件格式转换工具/353
附录/354
附录1基因组坐标体系/354
附录2常用数据格式/357
参考文献 /383
作者介绍:
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出版社信息:
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书籍信息完全性:3分
网站更新速度:7分
使用便利性:6分
书籍清晰度:3分
书籍格式兼容性:4分
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下载评价
- 网友 菱***兰: ( 2025-01-31 04:02:39 )
特好。有好多书
- 网友 步***青: ( 2025-01-09 11:39:04 )
。。。。。好
- 网友 丁***菱: ( 2025-01-13 20:01:41 )
好好好好好好好好好好好好好好好好好好好好好好好好好
- 网友 郗***兰: ( 2025-01-16 09:59:46 )
网站体验不错
- 网友 沈***松: ( 2025-01-22 04:53:14 )
挺好的,不错
- 网友 訾***雰: ( 2025-01-19 22:27:49 )
下载速度很快,我选择的是epub格式
- 网友 孔***旋: ( 2025-01-20 17:44:15 )
很好。顶一个希望越来越好,一直支持。
- 网友 温***欣: ( 2025-01-08 07:02:37 )
可以可以可以
- 网友 石***烟: ( 2025-01-21 22:49:15 )
还可以吧,毕竟也是要成本的,付费应该的,更何况下载速度还挺快的
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书籍真实打分
故事情节:9分
人物塑造:6分
主题深度:5分
文字风格:8分
语言运用:4分
文笔流畅:5分
思想传递:4分
知识深度:8分
知识广度:5分
实用性:9分
章节划分:9分
结构布局:6分
新颖与独特:9分
情感共鸣:3分
引人入胜:8分
现实相关:3分
沉浸感:7分
事实准确性:4分
文化贡献:7分